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第二类包括：Desulfobulbus、其中, 脱硫叶菌属(Desulfobulbus)与脱硫弧菌属(Desulfovibrio)属于变形菌门下厌氧型的硫酸盐还原菌(SRB), 可利用乳酸、酸、乙醇等作为碳源, 将硫酸盐还原为硫化氢这两种菌属的检出证实了反应器内存在硫酸盐还原, 与实验观察到SO42-减少的现象相一致在有较高浓度硫酸盐存在的厌氧反应体系中, 一般多存在硫酸盐还原菌(SRB)与产甲烷菌(MPB)对底物(乙酸和H2)的竞争作用, 往往由于SRB对H2和乙酸有较高的亲和力而在竞争中取胜, 从而对MPB产生初级抑制, 同时硫酸盐还原产生的H2S对MPB又会产生次级抑制作用菌种鉴定未发现产甲烷菌属, 说明产甲烷菌受到了抑制, UASB反应器很好地停留在了水解酸化阶段。
第三类包括： Thiobacillus、其中, 硫杆状菌属(Thiobacillus)属变形菌门下的硫氧化, 可将S2-氧化S0、SO42-, 其在种水平上的脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)比较特殊, 是目前研究的热门 denitrificans特殊之处在于好氧和厌氧条件下皆能进行硫氧化, 前者进行的是单一S2-氧化, 以O2为电子受体, 可将S2-氧化成S0、SO42-, 而后者以NO3--N作为电子受体, 可将S2-氧化成S0, 同时还原NO3--N成N2, 实现的是同步脱硫反硝化在种的水平上检测到了Thiobacillus denitrificans, 约占Thiobacillus的82%, 说明UASB反应器内存在同步脱氮除硫而属于变形菌门的弓形杆菌属(Arcobacter)也具有脱氮除硫功..。

小试研究采用单因素变量法, 采用连续流进水方式研究水力停留时间HRT=1125 h条件下(此HRT由中试研究确定为中试工艺中UASB反应器的佳水力停留时间)进水SO42-浓度(即C(SO42-))对UASB反应器出水指标去除率的影响, 以及采用间歇流进水方式研究进水C(SO42-)对反应器内NO2--N、NO3--N和S2-指标随反应时间变动的影响进水SO42-浓度用硫酸钠(Na2SO4)和氢氧化钙(Ca(OH)2)调节, 分别控制为0 mg˙L-1、50~150 mg˙L-1, 再用(HCl)调节pH=70~80, 其它指标不变, 其中, 用Ca(OH)2沉淀法去除进水中SO42-是作对比研究,
表 2 UASB反应器优势菌属及AOB、NOB及其丰度，在属的水平上未发现目前已知5种厌氧氨氧化菌属：Brocadia、Kuenenia、Scalindua、Jettenia、Anammoxoglobus, 故不认为存在厌氧氨氧化作用，23 小试研究。图 6 HRT=1125 h条件下进水C(SO42-)对UASB出水指标去除率影响。
图 6结果显示, 对比于C(SO42-)=0 mg˙L-1的进水条件, 当进水C(SO42-)增到50 mg˙L-1时, COD、TN去除率明显增加, 增幅分别为118%、58%, 同时, SO42-去除率为721%, 出水也检测到了05 mg˙L-1的S0, 说明在有硫酸盐存在的条件下, 硫酸盐还原作用影响COD和TN的去除而在50 mg˙L-1基础上继续增加进水SO42-浓度, COD、TN去除率也随之增大, 可见硫酸盐还原对COD、TN去除的影响随硫酸盐浓度的增加而加强。