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碳水化合物、脂肪和蛋白质的水解酸化过程分别为：，从厌氧发酵产生沼气的过程分析，它分为四个阶段：，缺氧阶段：固体物质降解为溶解性物质，大分子物质降解为小分子物质。主要起作用的微生物为兼氧性的缺氧菌，此阶段时间较短，酸化阶段：碳水化合物降解为脂肪酸。主要为醋酸、丙酸和丁酸，主要起作用的微生物为产酸菌，缺氧和酸化阶段进行得较快。
难于将其 分开，一般统称为缺氧，这两个阶段约为2-5h，酸性衰退阶段：有机酸和溶解的含氮化合物分解成氨、胺、碳酸盐和少量的CO2、N2、CH4和H2，由于产氨的活动。使氨态氮浓度增加，氧化还原电位降低，PH值上升。此阶段的副产物还有H2S、吲哚、粪臭素和硫醇。使厌氧发酵带有不良的气味均在这一 阶段，甲烷化阶段：由于PH值升高。
为甲烷菌创造了适宜的条件，甲烷菌把有机酸转化为沼气，此阶段时间较长约为15d左右，(6)缺氧池，缺氧池是相对厌氧和好氧来讲，一般是指溶解氧控制在之间的生化系统。缺氧池---有水解反应，在脱氮工艺中，其pH值升高。主要起反硝化去除硝态氮的作用，同时去除部分BOD。也有水解反应提高可生化性的作用，作为生物处理的核心关键设施。